Apostle MiniMaxTM 高效游离DNA富集分离试剂盒 (标准版)

专为高效富集分离游离DNA而设计


产品
产品 Cat# 用户手册
Apostle MiniMaxTM 高效游离DNA富集分离试剂盒 (标准版) (25-50 样本) A17622-50 Protocol (v27)
Apostle MiniMaxTM 高效游离DNA富集分离试剂盒 (标准版) (5-10 样本) A17622-10 Protocol (v27)
Apostle MiniMaxTM 高效纳米磁珠 (标准版) (5mL) A320
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Apostle MiniMax (标准版) 数据

Apostle MiniMaxTM 细胞游离DNA分离试剂盒(标准版)应用我司专利的 MiniMax纳米磁珠技术,是富集和分离超低浓度细胞游离DNA的卓越手段。与其他传统技术提供者比较, Apostle MiniMaxTM 细胞游离DNA分离试剂盒遗传物质分离不仅产率显著提高 (图1A),而且不受目标核酸片段大小影响,没有偏差 (图1B)。 这些杰出特性源自目标遗传物质与MiniMax纳米磁珠之间更有效的相互作用,包括更大的比表面积,独有的表面化学性质,更低的沉降率,以及纳米磁珠更强的磁反应性。

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图 1. Apostle专利MiniMax纳米磁珠高效、无偏差的cfDNA富集

A) 在TE buffer中加入DNA梯度(50-3000bp), 再用Apostle MimiMaxTM 高效游离DNA富集分离试剂盒进行富集。 Apostle MiniMaxTM 纳米磁珠(红线)与传统磁珠技术市场领导者(蓝线)比较,显示显著更优(2倍-10倍)的富集产率。 结果测量自标准DNA梯度TE溶液(50-3000bp)与 BioAnalyzer 2100 (Agilent)。

B) 在血清中加入DNA梯度 (50-3000bp), 再用Apostle MimiMaxTM 高效游离DNA富集分离试剂盒进行富集。Apostle MiniMaxTM 纳米磁珠(红线)与传统磁珠技术市场领导者(蓝线)比较,显示显著更优(2倍-10倍)的富集产率。 结果测量自标准DNA梯度标准血清(50-3000bp)与 BioAnalyzer 2100 (Agilent)。

Apostle MiniMaxTM 细胞游离DNA分离试剂盒在80-3000bp DNA区段可获得极高 (>95%)的游离DNA富集回收率。结果测量自标准DNA梯度标准血清(50-3000bp)与 Agilent BioAnalyzer 2100 (图2)。这一杰出特性源自目标游离遗传物质与Apostle MiniMaxTM 纳米磁珠之间更优化的相互作用,从而使得目标游离遗传物质在复杂生物样本中与磁珠间有效结合,以及其后目标游离遗传物质的完全洗脱。


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图 2. Apostle专利MiniMaxTM 纳米磁珠在80-3000bp间获得超过95%的游离DNA富集回收率。

结果测量自标准DNA梯度标准血清(50-3000bp)与 BioAnalyzer 2100 (Agilent)。富集回收前液(蓝色)与富集回收液(红色)相比较,显示DNA富集回收率超过95%。

Apostle专利MiniMaxTM 纳米磁珠研发和生产自高度质控和验证的科学流程,从而确保高度可重复的高效最优表现(图3)。


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图 3. 高度可重复的DNA分离效率。

结果测量自标准DNA梯度标准血清,使用三个生产批次的Apostle专利MiniMax TM 纳米磁珠进行DNA富集分离。使用BioAnalyzer 2100 (Agilent)进行三个批次间的比较。不同批次间的富集分离结果高度一致。

细胞游离DNA是一组高度碎片化的DNA分子的混合体,通常主峰在 ~170bp,二聚体峰在 ~340bp,三聚体峰在 ~510bp,以此类推(这与DNA与组蛋白 histone的复合结构及降解过程有关)。因此,最优化的细胞游离DNA分离技术应可以确保不同片段大小的细胞游离DNA都能高效富集分离,而不应选择性丢失潜在重要的检测信号。Apostle MiniMaxTM 细胞游离DNA分离试剂盒满足这一最优化的高标准需求,对不同大小的游离DNA梯度均有 >95% 的回收率。这一最优表现进一步为从人血浆中富集分离自然游离DNA(图4A),和人尿液中富集分离自然游离DNA(图4B)所反复验证。在这一系列人血浆、人尿液的验证实验中,Apostle MiniMaxTM 细胞游离DNA分离试剂盒(红线)对不同大小的游离DNA 均有极高效率的富集分离,尤其包括170bp, 340bp, 510bp等细胞游离DNA峰值;与传统磁珠技术市场领导者(蓝线)比较,富集分离率有极大的提高,确保液体活检、NIPT等检测的高效和准确。


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图 4. 人血浆、尿液中高效、无偏差的cfDNA富集。

A) 在人血浆中,Apostle MiniMaxTM 高效游离DNA富集分离试剂盒(红线)与传统磁珠技术市场领导者(蓝线)比较,显示显著更优的cfDNA富集产率。 人外周血液首先在2000g 4oC离心10分钟以获得血浆;血浆随后在16000g 4oC离心10分钟以去除细胞杂质。以Apostle MiniMaxTM 纳米磁珠(红线)与传统磁珠技术市场领导者(蓝线)分别于4mL去杂质血浆中分离cfDNA。结果测量自 BioAnalyzer 2100 (Agilent)。

B) 在人尿液中,Apostle MiniMaxTM 高效游离DNA富集分离试剂盒(红线)与传统磁珠技术市场领导者(蓝线)比较,显示显著更优的cfDNA富集产率。 人尿液在16000g 4oC离心10分钟以去除细胞杂质。以Apostle MiniMaxTM 纳米磁珠(红线)与传统磁珠技术市场领导者(蓝线)分别于20mL去杂质尿液中分离cfDNA。结果测量自 BioAnalyzer 2100 (Agilent)。

Apostle MiniMaxTM 高效游离DNA富集分离试剂盒确保下游 DNA 突变检测的准确、高效和可重复。图5 显示 qPCR 验证 DNA 突变检测的结果。


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图 5. 使用Apostle MiniMaxTM 高效游离DNA富集分离技术得到优秀的DNA突变检测结果

20 uL 不同浓度 (1 ng/uL, 0.1 ng/uL, 0.01 ng/uL, 0.001 ng/uL) 的 EGFR c.2573T>G L858R DNA突变片段 (~170 bp) 分别加入 1mL TE 溶液 (蓝色) 或血清 (红色)。使用Apostle MiniMaxTM 高效游离DNA富集分离试剂盒对突变DNA片段进行富集分离,终体积为20 uL 。 使用1 uL 富集分离液,以及 1 uL 各浓度下原液,进行qPCR并进行对比。

A) 扩增图(Amplification plot)显示各浓度下突变DNA片段原液与Apostle MiniMaxTM 高效游离DNA富集分离液高度重合的曲线。

B) 使用突变DNA片段原液产生的 qPCR 标准曲线用以定量Apostle MiniMaxTM 高效游离DNA富集分离的DNA片段。 在各浓度下,突变DNA检测均实现高效回收,回收率均 >90%。

注:图示的DNA浓度梯度 1, 0.1, 0.01, 0.001 ng/ul 是DNA突变片段原液在加入1mL血清之前的浓度。相对应的游离DNA富集分离的实际工作浓度分别为:20 pg/ul, 2 pg/ul, 0.2 pg/ul, 0.02 pg/ul。

Apostle MiniMaxTM 高效游离DNA富集分离试剂盒 (S版)

专为富集分离小片段cfDNA设计 ( <100bp)


产品
产品 Cat# 用户手册
Apostle MiniMaxTM 高效游离DNA富集分离试剂盒 (S版) (25-50 样本) A17830-50 Protocol (v27)
Apostle MiniMaxTM 高效游离DNA富集分离试剂盒 (S版) (5-10 样本) A17830-10 Protocol (v27)
Apostle MiniMaxTM 高效纳米磁珠 (S版) (5mL) A321
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Apostle MiniMaxTM (S版) 数据

Apostle MiniMaxTM 细胞游离DNA分离试剂盒(S版)应用我司专利的 MiniMax纳米磁珠技术,是富集和分离超低浓度细胞游离DNA的卓越手段。 与标准版相比,S版除了具备提高10%-10倍的抽提效率,还特别设计对于生物样本中小片段 cfDNA ( <100 bp) 有高效抽提(Exhibit 6 & 7)。 这一特点,对于生物样本中有显著小片段 cfDNA ( <100 bp)存在且需要分离时,极有帮助(Exhibit 6)(注:通常,cfDNA 可能由 ~170bp, ~340bp, ~510bp 等不连续峰组成)。


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图 6. 50-3000bp DNA区段 >95% 的抽提率。

标准DNA梯度在血清中,以Apostle MiniMaxTM 细胞游离DNA分离试剂盒(S版)进行抽提。 结果测量自 BioAnalyzer 2100 (Agilent),对富集回收前液(蓝色)与富集回收液(红色)相比较。 Apostle MiniMaxTM 细胞游离DNA分离试剂盒(S版)产生极佳的 DNA 回收率 (>95%),其中包括 ~50bp 的小片段DNA(绿色箭头)。

与使用传统技术的其他主要技术提供者相比,Apostle MiniMaxTM 细胞游离DNA分离试剂盒(S版)具有革命性的更佳表现,尤其在 <80bp 的小片段 cfDNA 区段。 (Exhibit 7).


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图 7A. 小片段 cfDNA 区段革命性的更佳表现。

标准 cfDNA 参照 (Horizon Discovery Ltd, Cat# HD780) 加入 TE 溶液中,并以Apostle MiniMaxTM 细胞游离DNA分离试剂盒(S版)进行抽提回收。 结果测量自 BioAnalyzer 2100 (Agilent),对富集回收前液(蓝色)与富集回收液(红色)相比较。Apostle MiniMaxTM细胞游离DNA分离试剂盒(S版)产生极佳的 标准 cfDNA 参照回收率 (>95%),其中包括 <100bp 的小片段DNA。
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图 7B. 小片段 cfDNA 区段革命性的更佳表现。

标准 cfDNA 参照 (Horizon Discovery Ltd, Cat# HD780) 加入 TE 溶液中,并分别以Apostle MiniMaxTM 细胞游离DNA分离试剂盒(S版)和一家其他主要技术提供者进行抽提回收, 并进行比较。BioAnalyzer 2100 (Agilent)的测量结果显示,Apostle MiniMaxTM 细胞游离DNA分离试剂盒(S版)(红色曲线)的抽提回收效率比其他主要技术提供者(蓝色曲线)显著更高(绿色箭头),尤其是在 <100bp。
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图 7C. 小片段 cfDNA 区段革命性的更佳表现。

放大显示 图7B在35bp – 100bp 的区段。 BioAnalyzer 2100 (Agilent)的测量结果显示,Apostle MiniMaxTM 细胞游离DNA分离试剂盒(S版)(红色曲线)在50bp及更短区段实现高效抽提回收,而其他主要技术提供者(蓝色曲线)抽提失败(绿色箭头)。